在《Fate/Zero》中，与征服王伊斯坎达尔一同跨越了第四次圣杯战争的少年，韦伯·维尔维特。时光流转，少年继承了君主·埃尔梅罗的称号，以君主·埃尔梅罗Ⅱ世的身份，在魔术师们的总部·时钟塔面临了各种充满神秘的事件——

主人公利姆露与仰慕他而聚集的众多魔物们所建立的国家＜朱拉·坦派斯特联邦国＞，经由与邻国的协议及交易，让「人类与魔物共同漫步的国家」这一温柔的理想逐步成形。利姆露身为曾是人类的史莱姆，从根本上拥有「对人类的好意」……但这个世界中却存在着明确的「对魔物的敌意」。当这一无理的现实摆在眼前时，利姆露将做出选择。做出「不希望失去…