距今45年前，初代假面骑士——本乡猛（藤冈弘饰）诞生于世。历经将近半个世纪的斗争，本乡的足迹早已遍布全球。当他听说一名女子正陷入危机中时，当机立断赶回了祖国日本。原来修卡盯上了一个名叫立花麻由的女孩子，只要抓住她，就有可能复活组织内的最高干部——地狱大使。本乡在得知修卡的阴谋后，连忙找到好友——假面骑士Ghost的变身者天空…

　　一心想成为幽灵猎人的天空寺尊于18岁生日时，收到来自十年前亡父生前所寄的幽灵眼魂（Ghost Eyecon）后，来自异世界的怪人——眼魔突如其来地出现在面前并盯上此物，甚至为救青梅竹马月村明里和御成而身亡。得到仙人的帮助之下而获得Ghost驱动器变身，成为假面骑士Ghost并得以九十九日短暂的生命复苏。为收集实现复活愿望的「15位伟人」眼…