- 本剧场版紧接TV版第27话。在27话良太郎一行人为了追踪异魔神而回到过去，但他们却不知道自己已经落入了牙王的圈套。当良太郎等人消灭完异魔神并想回到Den-Liner的时侯，却发现Den-Liner已经被牙王劫持…… 众人被逼留在过去，最坏的情况是良太郎失去了成为电王的所有记忆，桃泰诺斯也因此不能附上良太郎的身体。在机缘巧合下，良太郎遇到10…
- 良太郎（溝口琢矢）とモモタロスたちが協力して謎のイマジンの探索をしていると、そこにイマジンに憑依（ひょうい）された海東大樹（戸谷公人）が現れる。彼はまんまと電王のパスとデンライナーを盗むことに成功し、悠々と去って行く。良太郎たちがショックでぼうぜんとしていると、そこに時間警察の黒崎レイジが（古川雄大）が姿を現す。
- イマジンによる乗車チケットの盗難事件がターミナルで発生し、良太郎（溝口琢矢）とモモタロスはチケットを奪い返そうとするが、逆に深手を負ってしまう。助っ人として、幸太郎（桜田通）とテディが現われるが、両者の契約は終了したとオーナー（石丸謙二郎）が衝撃の発言をいきなり浴びせる。
- 反塔罗斯军团袭击了银行，还偷走了电王的巴士，妄图统治全世界。为了打到恶徒，“电轨署”成立了，桃塔罗斯等人干劲十足地开始了调查。警视厅派来了铃木刑事负责此案，铃木是个很胆小的警察，让良太郎他们哭笑不得，但又不得不协助他的工作。一行人成功潜入反塔罗斯军团的秘密基地，不料中了机关，被困陷阱。侑斗侥幸逃了出来。而此时，反塔…
- ある日、デンライナーが操縦不能になったとモモタロスが良太郎（溝口琢矢）に助けを求めてくる。彼らがデンライナーにかかりきりになっている間に、良太郎の姉の愛理（松本若菜）が不幸にも何者かに襲われるというアクシデントが発生する。実は、その事件を裏で操っているのは侑斗（中村優一）だということが発覚するが……。
- 2008年1月の放送終了後も根強い人気を誇る「仮面ライダー電王」の最後の戦いを描く劇場版第3弾。世間で噂の幽霊列車について調査を開始したモモタロスたちの前に、“仮面ライダー幽汽”が立ちはだかる。なんとその正体は、誘拐された電王・良太郎だった。モモタロスや新たに電王となった幸太郎らは、良太郎の言葉を手がかりにデンライナーで…
